Seminarium z fizyki biologicznej i bioinformatyki
Instytutu Biochemii i Biofizyki PAN, Instytutu Fizyki PAN i ICM UW odbywa sie raz na dwa tygodnie na zmiane w obu instytutach.

Środa, 22 marca 2017, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Maciej Maciejczyk
(Uniwersytet Warminsko-Mazurski)

DNA-duplex formation with physics-based coarse-grained model




Środa, 8 marca 2017, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Prof. Michael Farle
(Universitat Duisburg-Essen, Germany & Immanuel Kant Baltic Federal University, Kaliningrad, Russia)

Functionalized Hybrid Nanomagnets: New Materialsfor Innovations in Energy Storage and Medical Theranostics




Środa, 18 stycznia 2017, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr hab. Dariusz Plewczynski
(Laboratorium Genomiki Strukturalnej i Funkcjonalnej, CENT, UW)

Data-driven computational modeling of three-dimensional human genome architectur




Środa, 4 stycznia 2017, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Olaf Morawski
(Instytut Fizyki PAN)

The direct photocatalytic partial water oxidation - the new approach to water splitting




Środa, 14 grudnia 2016, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Jarosław Poznański
(IBB PAN)

Thermodynamic contribution of halogen bonding in protein-ligand complexes




Środa, 30 listopada 2016, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr. Rocco Caliandrio
(Institute of Crystallopgraphy, CNR, Bari, Italy)

New tools and techniques for investigating protein structural dynamics




Środa, 16 listopada 2016, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Prof. Jarosław Poznański
(IBB PAN)

Wiązanie halogenowe w układach białko-ligand




Środa, 26 października 2016, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

mgr Mateusz Chwastyk
(Instytut Fizyki PAN)

Topological changes in knotted proteins




Środa, 12 października 2016, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Dr. Eugene P. Petrov
(Max Planck Institute of Cellular and Molecular Biophysics, Martinsried near Munich, Germany)

Macromolecules and colloids on lipid membranes: Brownian motion, conformational dynamics, and membrane-driven self-organization




Środa, 21 września 2016, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr. Giovanni La Penna
(Istituto di Chimica dei Composti OrganoMettallici CNR, Sesto Fiorentino, Italy)

Ions and disordered proteins




Środa, 11 maja 2016, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Adolfo Poma
(Instytut Fizyki PAN)

Computational Model for Native Cellulose I and the Transformation Pathways for I-alpha to I-beta Transitions




Środa, 27 kwietnia 2016, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Anna Ajduk
(Wydział Biologii UW)

Optical Coherence Microscopy: a novel non-invasive method for visualisation of intracellular architecture and dynamics




Środa, 13 kwietnia 2016, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr hab. prof. UW Wojciech Dzwolak
(Wydział Chemii UW)

(Very) Fast Self-Assembly of Amyloid Fibrils




Środa, 30 marca 2016, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Jan Antosiewicz
(Wydział Fizyki UW)

UV-Vis spectroscopy of tyrosine side-groups in studies of protein structure




Środa, 16 marca 2016, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

mgr Maciej Wojcikowski
(IBB, Warszawa)

Performance of machine learning scoring functions in virtual screening




Środa, 2 marca 2016, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Prof. Jonas Schartner
(Department of Biophysics, Ruhr-University Bochum, Germany)

Germanium catches proteins in action




Środa, 27 stycznia 2016, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Paweł Szczęsny
(IBB, Wydział Biologii UW)

Ribosomal hiccups - gene expression regulation by polyadenine tracks in coding regions




Środa, 13 stycznia 2016, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Prof. Jarosław Stolarski
(Instytut Geologii PAN, Warszawa)

Coral biomineralization and the global climate change




Środa, 16 grudnia 2015, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

mgr Izabela Kamińska
(Instytut Fizyki PAN, Warszawa)

Nanostruktury tlenkowe do obrazowania in vitro




Środa, 2 grudnia 2015, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Piotr Setny
(Centrum Nowych Technologii UW, Warszawa)

Hydratation in discrete water: from bulk free energies to localised water molecules




Środa, 18 listopada 2015, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Krzysztof Sozański
(Instytut Chemii Fizycznej PAN, Warszawa)

How to break a molecular motor: A study of kinesin motion in a crowded environment




Środa, 21 października 2015, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Dorota Niedzialek
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej, Warszawa)

The idea of a molecular lever mechanically dissociating neurotoxic assemblies of alpha-synuclein




Środa, 7 października 2015, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr. Andrzej Kulik
(Ecole Polytechnique Federale Lausanne, Szwajacaria)

Nanoscale Infrared Spectroscopy: applications in biology of LHCII proteins and amyloids




Środa, 20 maja 2015, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Adolfo B. Poma
(Instytut Fizyki PAN)

Rare events in biophysics: how to accelerate molecular dynamics




Środa, 22 kwietnia 2015, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. Maciej Garstka
(Wydział Biologii, UW)

Zmienność struktury błon tylakoidów roślin wyższych




Środa, 1 kwietnia 2015, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Elżbieta Pedziwiatr-Werbicka
(Wydział Biologii, Uniwersytet Łódzki)

Nanocząstki jako wektory w terapii genowej - badania in vitro

dr Katarzyna Milowska
(Wydział Biologii, Uniwersytet Łódzki)

Dendrymery jako potencjalne leki w chorobie Parkinsona




Środa, 11 marca 2015, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

mgr Joanna Starzyk
(Instytut Fizyki UMCS, Lublin)

Badanie samoorganizacji antybiotyku amfoterycyny B metodami spektroskopii molekularnej




Środa, 25 marca 2015, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Prof. Robert Szoszkiewicz
(Department of Physics, Kansas State University, Manhattan, KS, USA)

Stiffness and internal friction of single protein molecules: AFM studies




Środa, 18 lutego 2015, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Dr. Panagiotis Theodorakis
(Imperial College, London)

Self-assembly of DNA-coated colloids




Środa, 28 stycznia 2015, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Michał Wojciechowski
(Instytut Fizyki PAN)

Unfolding of proteins by the proteasome in a coarse-grained model




Środa, 7 stycznia 2015, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr hab. Szymon Kaczanowski
(IBB)

Why males are in such a rush?




Środa, 17 grudnia 2014, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Anna Ochab-Marciniak
(Instytut Chemii Fizycznej PAN)

Transcription factor binding as a nonlinear noise filter




Środa, 26 listopada 2014, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Remigiusz Worch
(Instytut Fizyki PAN)

The influenza virus fusion peptide studied in artificial membarne systems




Środa, 19 listopada 2014, godz. 15:15
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr Evzen Boura
(Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Academy of Sciences the Czech Republic, Prague, Czech Republic)

Crystal structures of Phosphatidylinositol 4-Kinases




Środa, 5 listopada 2014, godz. 15:15
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Dr. Rocco Caliandro
(Institute of Crystallography, National Research Council of Italy, Bari, Italy)

New algorithms for protein dynamics studies and their applications to protein crystallography




Środa, 22 października 2014, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Bartosz Różycki
(Instytut Fizyki PAN)

Spontaneous curvature of bilayer membranes: Asymmetric lipid densities and asymmetric adsorption




Środa, 8 października 2014, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Angel Gomez-Scilia
(Protein Nanomechanics Lab, Cajal Institute, CSIC, Madrid, Spain)

The secret life of intrinsically disordered proteins




Środa, 21 maja 2014, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Wiesław Nowak
(Instytut Fizyki Mikołaja Kopernika)

Single molecule nanomechanics from computational point of view: saccharides, proteins and DNA




Środa, 14 maja 2014, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Łukasz Rok
(Schaefer Technologie GmbH, Langen, Niemcy)

Mikroskop sił atomowych FluidFM wykorzystujący sondy z otwartym zakończeniem (np. do pomiaru adhezji)




Środa, 7 maja 2014, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

mgr Mateusz Chwastyk
(Instytut Fizyki PAN)

Białka z wnękami i węzłami w modelach gruboziarnistych




Środa, 23 kwietnia 2014, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr hab. Piotr Bednarczyk
(Katdera Fizyki SGGW)

Strukturalne i funkcjonalne sprzężenie mitochondrialnego kanału BKCa z łańcuchem oddechowym




Środa, 9 kwietnia 2014, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. nzw. dr hab. Artur Zdunek
(Instytut Agrofizyki PAN, Lublin)

Struktura i funkcja ściany komórkowej (w tym pektyn, hemicelulozy i celulozy) roślin




Środa, 26 marca 2014, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. dr hab. Wiesław Gruszecki
(Zakład Biofizyki, UMCS Lublin)

Racjonalna choć nie planowa gospodarka wzbudzeniami elektronowymi w roślinach




Środa, 12 marca 2014, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Adriana Palińska-Saadi
(Instytut Fizyki PAN)

Sitodrukowane czujniki elektrochemiczne w badaniach oddziaływań DNA z błekitem metylenowym, antracyklinami i ich formamidynowymi pochodnymi




Środa, 26 lutego 2014, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Prof. Fernando Luis Barroso da Silva
(Department of Physics and Chemistry, Faculty of Pharmaceutical Sciences at Riberao Preto - University of Sao Paulo, Brazylia)

Molecular modeling of protein complexes driven by electrostatic interactions with interest for industries and biosciences




Środa, 22 stycznia 2014, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr hab. Szymon Kaczanowski
(IBB)

Samobójstwa jednokomorkowców




Środa, 8 stycznia 2014, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. dr hab. Marek Cieplak
(Instytut Fizyki PAN)

Krajobrazy energetyczne białek w modelach sieciowych

Dziesięciolecie Fizyki Biologicznej w IFPAN

Dostępne materiały:




Środa, 18 grudnia 2013, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Grzegorz Chwastek
(Instytut Fizyki PAN)

Fluorescence techniques in studies of lipid monolayers




Środa, 11 grudnia 2013, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Grzegorz Wieczorek
(IBB)

Symulacje ludzkiej paraoxonazy 1




Środa, 20 listopada 2013, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Artur Podhorodecki
(Instytut Fizyki Politechniki Wrocławskiej)

Synteza oraz optyczne właściwości nanokryształów fluorkowych domieszkowanych jonami ziem rzadkich do zastosowań w medycynie i biologii




Środa, 6 listopada 2013, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Bartosz Rożycki
(Instytut Fizyki PAN)

Adhezja błon komórkowych - efekty kooperatywnego wiązania receptorów adhezyjnych i tworzenia domen w synapsie immunologicznej




Środa, 23 października 2013, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Bartosz Rożycki
(Instytut Fizyki PAN)

Adhezja błon komórkowych - efekty kooperatywnego wiązania receptorów adhezyjnych i tworzenia domen w synapsie immunologicznej




Środa, 9 października 2013, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr inż. Michał J. Wozniak
(Wydział Inżynierii Materiałowej, Polietchnika Warszawska)

Mikroskop AFM jako narzędzie w badaniach biomateriałów dla potrzeb inżynierii tkankowej oraz narzędzie wspomagające ocenę toksyczności nanomateriałów




Środa, 25 września 2013, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Prof. Ewa Goldys
(MQ BioFocus Research Centre, Mcquarie University, Sydney, Australia)

Nanoparticle bioprobes for advanced bioimaging and biosensing




Środa, 4 września 2013, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Eun-ju Lee
(Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO), Clayton, Australia)

Surface Chemistry Tool for Cell Biology




Środa, 8 maja 2013, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Agata Świątkowska
(Instytut Chemii Bioorganicznej, Poznań)

Struktura końca 5 p53 mRNA i jego funkcja w translacji białka p53 i jego delta N-izoformy




Środa, 17 kwietnia 2013, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Joanna Sułkowska
(Wydział Chemii UW)

Przewidywanie struktury białek w oparciu o genomikę




Środa, 3 kwietnia 2013, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Seminarium odwołane - problemy zdrowotne prelegenta

dr Artur Podhorecki
(Politechnika Wrocławska, Laboratorium Spektorskopii Optycznej i Nanostruktur)

Synteza oraz optyczne właściwości nanokryształów fluorkowych domieszkowanych jonami ziem rzadkich do zastosowań w medycynie i biologii




Środa, 20 marca 2013, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Wojciech Bal
(IBB)

Cała prawda o pH




Środa, 6 marca 2013, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. dr hab. Jolanta Zakrzewska-Czerwińska
(Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii)

Dynamika organizacji chromosomu bakteryjnego




Środa, 20 lutego 2013, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Jolanta Redowicz
(Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Miozyny - motory cytoplazmatyczne i jądrowe




Środa, 23 stycznia 2013, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Joanna Grzyb
(Instytut Fizyki PAN)

Nanostruktury hybrydowe o aktywności enzymatycznej




Środa, 9 stycznia 2013, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Sławomir Filipek
(Wydział Chemii UW)

Receptory błonowe GPCR: struktury i mechanizmy aktywacji. Nobel 2012




Środa, 19 grudnia 2012, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr. Ellinor Haglund
(University of California San Diego)

The unique cysteine knot regulates the pleotropic hormone leptin




Środa, 12 grudnia 2012, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Bartosz Rożycki
(Instytut Fizyki PAN)

Konformacje białek wielodomenowych i kompleksów białkowych badane przy użyciu połączenia symulacji molekularnych z doświadczeniami SAXS, EPR, FRET i NMR




Środa, 5 grudnia 2012, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr hab. Marcin Grynberg
(IBB)

Ewolucja białek wielodomenowych




Środa, 21 listopada 2012, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

mgr Anna Baranowska-Korczyc
(Instytut Fizyki PAN)

Od nanowłókien po bioczujniki, czyli o materiałach elektroprzędzonych i ich zastosowaniu




Środa, 7 listopada 2012, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Joanna Trylska
(Centrum Nowych Technologii UW)

Oddziaływania antybiotykąw z RNA rybosomu




Środa, 17 października 2012, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Beata Myśliwa-Kurdziel
(Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii, UJ)

Protochlorofilid jako substrat zależnej od światła oksydoreduktazy




Środa, 3 października 2012, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. dr hab. Andrzej Jerzmanowski
(IBB i Wydział Biologii UW)

Lokalna i globalna funkcja białek strukturalnych w chromosomach




Środa, 26 września 2012, godz. 15:30
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Prof. Ron Elber
(University of Texas at Austin, Department of Chemistry and Biochemistry)

What is Life?




Środa, 23 maja 2012, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Michał Bystrzejewski
(Wydział Chemii UW)

Magnetyczne hybrydowe nanomateriały węglowe: otrzymywanie, właściwości, zastosowania




Piątek, 11 maja 2012, godz. 12:15
IPPT PAN, Aula na II pietrze

Prof. Marek Kimmel
(Department of Statistics, Rice University, Houston, TX)

Cell cycle regulation, homeostasis, switches and stochasticity: some questions


Abstract

Mathematical models constructed three decades ago demonstrated homeostasis in cell populations under a range of alternative mechanisms of growth regulation and unequal division scenarios. They lead to sophisticated theorem, but not enough data were present to make the predictions interesting for mainstream biologists. Recently, such data have become available. One of the interesting questions to be addressed is the dynamics of toggle switches under stochastic models of cell proliferation.

We propose a framework based on classical multitype branching processes and the so-called sampling formulae recently developed by Shaw and Olofsson.


Short biogram

Professor Kimmel graduated at Silesian Technical University, MS 1977, PhD 1980. In 1986-1990 he was Assistant Professor in Memorial Sloan-Kettering Cancer Center in New York. From 1994 he is Professor of Statistics, and from 2009 Professor of Bioengineering at Rice University, Houston, Texas.

His principal interests are systems biology (modeling of signaling pathways, modeling structure and function of biomolecules), stochastic modeling of human diseases (including cancer progression, detection and treatment), branching processes and statistical and population genetics of human disease.

He is author or coauthor of about 190 peer review publications; H-factor 35; ca. 4000 citations.



Środa, 9 maja 2012, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Nathalie Reuter
(Uniwersytet w Bergen, Norwegia)

Interfacial binding sites of peripheral membrane proteins: insights from computations and experiments




Środa, 25 kwietnia 2012, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Bohdan Paterczyk
(Pracownia Mikroskopii Elektronowej i Konfokalnej, Wydział Biologii UW)

SAIVI - przyżyciowa analiza lokalizacji nanokryształów fluorescencyjnych w małych zwierzętach laboratoryjnych




Środa, 28 marca 2012, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Beata Hat
(IPPT)

Oscylacje i bistabilność w ukladzie regulatorowym p53




Środa, 14 marca 2012, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

mgr Bożena Sikora
(Instytut Fizyki PAN)

Strategie projektowania biosensorów połprzewodnikowych do zastosowań w biologii i medycynie




Środa, 29 lutego 2012, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr hab. prof. Mariusz Gagos
(Wydział Biologii i Biotechnologii UMCS i Zakład Biofizyki Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie)

Spektroskopowe i strukturalne badania organizacji molekularnej antybiotyku amfoterycyny B w układach biologicznych




Środa, 15 lutego 2012, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Anna Ajduk
(Wydział Biologii UW)

Dynamika cytoplazmy jako nowy wskaźnik oceny potencjału rozwojowego zarodków ssaków




Środa, 25 stycznia 2012, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Prof. Massimo Vassalli
(Instytut Biofizyki, Uniwersytet Florencki, Włochy)

Multiscale characterization of a chimeric biomimetic polypeptide for stem cells scaffolding

Seminarium promocyjne projektu NanoFun współfinansowanego ze środków Unii Europejskiej w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka



Środa, 11 stycznia 2012, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. dr hab. Andrzej Huczko
(Wydział Chemii UW)

Otrzymywanie nanomateriałów na drodze wysokoenergetycznej aktywacji reagentów




Środa, 14 grudnia 2011, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Jan Antosiewicz
(Zakład Biofizyki, Wydział Fizyki UW)

Oddziaływania hydrodynamiczne w kinetyce asocjacji molekul: obserwacje tworzenia kompleksów lizozymu z N, N', N''-triacetylo chitotrioza w spektrometrze zatrzymanego przepływu




Środa, 30 listopada 2011, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Matthias Bochtler
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej, IBB)

Three lectures on the proteasome: III. The redulatory particle, the control unit of proteasome




Środa, 23 listopada 2011, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. Matthias Bochtler
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej, IBB)

Three lectures on the proteasome: The core particle, the catalytic engine of the proteasome




Środa, 2 listopada 2011, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Matthias Bochtler
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej, IBB)

Three lectures on the proteasome: I. Protein degradation in eukaryotes




Środa, 19 października 2011, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr hab. Mikolaj Olejniczak
(Wydział Biologii, Uniwersytet im. Mikołaja Kopernika, Poznań)

Białka opiekuńcze RNA u bakterii




Środa, 5 października 2011, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Remigiusz Worch
(Instytut Fizyki PAN)

Dlaczego warto badać białka błonowe w błonie?
O tworzeniu kompleksów przez receptor interleukiny-4





Środa, 14 września 2011, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Dr. M. Miller
(National Cancer Institute,USA)

Structural Insights into of Transcription Factor C/EBPbeta




Środa, 1 czerwca 2011, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Paweł Daniluk
(Zakład Biofizyki UW i Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN)

Porównywanie struktur przestrzennych białek




Środa, 18 maja 2011, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. nzw. dr hab. Leonora Bużańska
(Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN)

Decyzje rozwojowe komórek macierzystych w środowisku biomimicznym




Środa, 11 maja 2011, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Paweł Daniluk
(Zakład Biofizyki UW i Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN)

Porównywanie struktur przestrzennych białek
Seminarium odwołane.



Środa, 27 kwietnia 2011, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. Janusz Bujnicki
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej)

New tools for RNA 3D structure modeling: inspirations from the protein world




Środa, 20 kwietnia 2011, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

mgr Oliwia Szklarczyk
(Department of Chemistry and Applied Biosciences, ETH Zurich)

Simulations of crystals: revelations and traps of amyloid fibrils molecular dynamics




Środa, 13 kwietnia 2011, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Krystiana Krzyśko
(Zakład Biofizyki, Wydział Fizyki, UW)

Topoizomeraza 1 i i jej enzymatyczna aktywność kinazowa - badania z wykorzystaniem metod molekularnego modelowania i bioinformatyki




Środa, 30 marca 2011, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Krzysztof Lewiński
(Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego)

Wysokie ciśnienie w badaniach strukturalnych makroczastek




Środa, 16 marca 2011, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Alexandre Morozov
(Department of Physics and Astronomy, Rutgers University, USA)

Biophysical models of chromatin structure and energetics




Środa, 2 marca 2011, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Michał Wojciechowski
(Instytut Fizyki PAN)

Zachowanie białek w ograniczonej przestrzeni i w warunkach tłoku molekularnego - rola oddziaływań hydrodynamicznych




Środa, 16 lutego 2011, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr hab. Izabela Makałowska
(Wydział Biologii UAM, Poznań)

Retropozycja - niedoceniony naped ewolucji




Czwartek, 20 stycznia 2011, godz. 14:30
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Dr Jarosław Majewski
(Manuel Lujan Jr. Neutron Scattering Center, Los Alamos National Laboratory)

Probing the Structure and Stability of Lipid Rafts




Środa, 19 stycznia 2011, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. dr hab. Andrzej Dobek
(Wydział Fizyki UAM, Poznań)

Przeniesienie energii wzbudzenia i elektronu w błonach bakterii fotosyntetycznych i roślin zielonych modyfikowanych fizyko-chemicznie i genetycznie




Środa, 12 stycznia 2011, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr hab. Piotr Szymczak
(Instytut Fizyki Teoretycznej Wydziału Fizyki UW)

Zmiany konformacji białek pod wpływem siły okresowej




Środa, 15 grudnia 2010, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Marta Pasenkiewicz-Gierula
(Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii, UJ)

Cholesterol w soczewce oka - postulowana funkcja




Środa, 1 grudnia 2010, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr hab. Tomasz Ciach
(Wydział Inżynierii Chemicznej i Procesowej PW)

Inżynieria biomedyczna: implanty i systemy podawania leków




Środa, 17 listopada 2010, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Artur Krężel
(Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Wrocławskiego)

Sondy fluorescencyjne w badaniach homeostazy cynku




Środa, 3 listopada 2010, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Jakub Włodarczyk
(Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Metody mikroskopii konfokalnej, bazujące na zjawisku fluorescencyjnego rezonansowego przeniesienia energii, do badania oddziaływania białko-białko




Środa, 20 października 2010, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

mgr Marlena Siwiak
(IBB PAN)

Opis translacji w czasie dla wszystkich białek komórki




Poniedziałek, 18 października 2010, godz. 12:30
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Remigiusz Worch
(Biophysics Group, Biotec, Technical University, Dresden)

Fluktuacje pod mikroskopem - spektroskopia korelacji fluorescencji




Środa, 6 października 2010, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Andrzej Sobolewski
(Instytut Fizyki PAN)

Fizyka wiązania wodorowego: od teorii do bio-inspirowanych zastosowań




Środa, 19 maja 2010, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr hab. Jarosław Poznański
(IBB PAN)

Badania strukturalne białek rozwiniętych




Środa, 5 maja 2010, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Paweł Szczęsny
(Wydział Biologii UW i IBB)

Trimeryczne adhezyny autotransportowe: relacje sekwencja-struktura w układach trimerycznych




Środa, 21 kwietnia 2010, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Jarosław Stolarski
(Instytut Paleobiologii PAN, Warszawa)

Ślady życia w kamieniu, czyli o wpływie organizmów na mineralizacje szkieletu




Środa, 7 kwietnia 2010, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Jan Antosiewicz
(Zakład Biofizyki IFD, UW)

Protonacyjne stopnie swobody w konformacyjnych przejściach białek indukowanych przez zmiany pH




Środa, 24 marca 2010, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr hab. Tomasz Lipniacki
(IPPT)

Aktywacja limfocytu B: równania reakcji-dyfuzji dla kaskady kinaz




Środa, 10 marca 2010, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Andrzej Koliński
(Wydział Chemii UW)

Wieloskalowe modelowanie białek




Środa, 24 lutego 2010, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Maciej Długosz
(ICM UW)

Symulacje dynamiki molekularnej N-terminalnych fragmentów huntingtyny. Konsekwencje dla agregacji.




Środa, 27 stycznia 2010, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Maciej Żylicz
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej)

Udział białek opiekuńczych w zwijaniu się innych białek




Środa, 20 stycznia 2010, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Agnieszka Chacińska
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej)

Jak zbudować mitochondria?




Środa, 13 stycznia 2010, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Aleksandra Walczak
(Princeton University, USA)

Przetwarzanie informacji w małych układach regulujących ekspresję genów




Piątek, 18 grudnia 2009, godz. 11:00
Zakład Biofizyki Instytutu Fizyki Doświadczalnej, Wydziału Fizyki, UW
ul. Zwirki i Wigury 93, sala nr 3091

dr Joanna I. Sułkowska
(Instytut Fizyki PAN & University of California San Diego)

Omijanie kryzysu w zwijaniu się białek z węzłami




Środa, 2 grudnia 2009, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Wiesław Nowak
(UMK, Toruń)

Komputerowe badania nanomechaniki biopolimerów - białka macierzy zewnątrzkomórkowej




Środa, 25 listopada 2009, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Thomas Weikl
(Max Planck Institute of Colloids and Interfaces, Potsdam, Niemcy)

Folding, binding and adhesion: statistical-physical models of proteins




Środa, 18 listopada 2009, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Tomasz Kowalewski
(IPPT)

Mikroprzepływy: narzędzie diagnostyki i manipulacji w naukach biomedycznych




Środa, 28 października 2009, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Harald Janovjak
(Department of Molecular and Cell Biology, UC Berkeley, USA)

Controlling membrane protein structure and function




Środa, 14 października 2009, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Joanna Grzyb
(Instytut Fizyki PAN)

Białka projektowane de novo (makiety białkowe) w badaniach białek z centrami żelazo-siarkowymi i hemem




Środa, 30 września 2009, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Borys Wróbel
(Grupa Biologii Obliczeniowej, Instytut Oceanologii PAN, Sopot)

Ewolucja sieci genowych regulujacych sztuczną embriogenezę w trójwymiarowej przestrzeni z symulowaną fizyką




Środa, 20 maja 2009, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A


Seminarium specjalne - dwa 35 minutowe referaty

Dr Andriy Kryshtafovych
(Protein Structure Prediction Center, University of California at Davis)

CASP - A driving force in protein structure prediction

Dr Torgeir Hvidsten
(Umea Plant Science Center
Umea University and Swedish University of Agricultural Sciences)

A systems biology approach to model the transcriptional network in trees



Środa, 13 maja 2009, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Marcin Grynberg
(Instytut Biochemii i Biofizyki PAN)

Aerolysins: a family update



Środa, 29 kwietnia 2009, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. Ryszard Stolarski
(Zakład Biofizyki, Wydział Fizyki, UW)

Wielofunkcyjne białko CBC - dynamika wiązania końca 5' mRNA



Środa, 15 kwietnia 2009, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr hab. Sebastian Maćkowski
(Wydział Fizyki, Uniwersytet im. Mikolaja Kopernika w Toruniu)

Spektroskopia fluorescencyjna pojedyńczych kompleksów fotosyntetycznych



Środa, 1 kwietnia 2009, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Beata Kutrowska
(Zakład Biofizyki, Wydział Fizyki, UW)

Green Fluorescent Protein (GFP) - Nagroda Nobla z Chemii 2008



Środa, 11 marca 2009, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Mirosław Dudek
(Uniwersytet w Zielonej Górze)

Nanocząstki magnetyczne w nano-biomateriałach



Środa, 4 marca 2009, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. Joanna Kufel
(Wydział Biologii, UW)

Wszystkie RNA duże i małe



Środa, 25 lutego 2009, godz. 14:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Zofia Szweykowska-Kulińska
(Wydział Biologii, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza)

Biogeneza roslinnych mikro-RNA i nowe aspekty regulacji ekspresji genów



Środa, 21 stycznia 2009, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

mgr Julia Romanowska
(ICM UW)

Własności miejsca wiążacego antybiotyki aminoklikozydowe w rybosomie



Środa, 14 stycznia 2009, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Aleksandra Wysłouch-Cieszyńska
(Instytut Biochemii i Biofizyki PAN)

S-nitrozylacja cystein - jedna z ważnych modyfikacji potranslacyjnych białek



Środa, 17 grudnia 2008, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

mgr Zuzanna Szymańska
(ICM UW)

Indukcja białek szoku termicznego i ich udział w inicjowaniu procesów nowotworowych



Środa, 3 grudnia 2008, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Tadeusz Kosztolowicz
(Instytut Fizyki, Uniwersytet Jana Kochanowskiego, Kielce)

Subdyfuzyjny model rozwoju prochnicy



Środa, 26 listopada 2008, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

mgr inz. Rafał Biedrzycki
(Wydział Elektroniki i Technik Informacyjnych PW)

Konstruktywna indukcja w zadaniu klasyfikacji sekwencji DNA



Środa, 12 listopada 2008, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. dr hab. Teresa Zołądek
(Instytut Biochemii i Biofizyki PAN)

Udział ligazy ubikwitynowej Rsp5/Nedd4 w transporcie białek i organizacji cytoszkieletu aktynowego u drożdży S. cerevisiae



Środa, 22 października 2008, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr hab. Wojciech Dzwolak
(Wydział Chemii UW)

Chiralna bifurkacja - nowe zjawisko w misfoldingu i agregacji białek



Środa, 8 października 2008, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr hab. Paweł Pomorski
(Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Cytoszkielet a homeostaza wapniowa



Środa, 4 czerwca 2008, godz. 15:00
sala A, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Prof. Krzysztof Kuczera
(University of Kansas at Lawrence, Department of Chemistry and Department of Molecular Biosciences)

Simulation of peptide folding kinetics with milestoning



Środa, 14 maja 2008, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Anna Niedźwiecka (Instytut Fizyki PAN)

Pare uwag o komunikacji konców 5' i 3' w metabolizmie eukariotycznego mRNA



Środa, 7 maja 2008, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Radoslaw Przeniosło (Instytut Fizyki Doświadczalnej UW)

Własności strukturalne i termiczne biogenicznego CaCo3 - badania szkieletów koralowców



Środa, 23 kwietnia 2008, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Marta Pasenkiewicz-Gierula (Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii, UJ, Kraków)

Jak białko kotwiczy sie w błonie



Środa, 9 kwietnia 2008, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Jacek Jaworski (IIMCB, Warszawa)

mTOR - wielofunkcyjna kinaza w układzie nerwowym



Środa, 26 marca 2008, godz. 15:00
sala A, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr hab. Piotr Garstecki (Instytut Chemii Fizycznej, Warszawa)

Dlaczego bakterie E. coli pływają prawą stroną?



Środa, 27 lutego 2008, godz. 15:00
sala A, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. Piotr Stępień (Instytut Biochemii i Biofizyki)

Jeden gen wiele funkcji - opowieść o ludzkiej helikazie RNA



Środa, 20 lutego 2008, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr hab. Marek Tchórzewski (Wydział Biologii i Nauk o Ziemi, UMCS, Lublin)

Struktura i funkcja elementów tworzących rybosomalne centrum GTPazowe



Środa, 23 stycznia 2008, godz. 15:00
sala A, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Sebastian Kmiecik (Wydział Chemii UW)

Wielkoskalowe symulacje mechanizmów zwijania białek globularnych



Środa, 9 stycznia 2008, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

prof. Wojciech Rode (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Modyfikacje potranslacyjne a właściwosci katalityczne i niekatalityczne



Środa, 19 grudnia 2007, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Maciej Długosz (ICM UW)

Asocjacja antybiotyków aminoglikozydowych z rybosomalnym miejscem A. Symulacje dynamiki Brownowskiej.



Środa, 5 grudnia 2007, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Agnieszka Jabłonowska (IBB)

Spektroskopia mas w badaniach struktury oligomerow peptydu Abeta związanego z chorobą Alzheimera



Środa, 28 listopada 2007, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Anna Ajduk (Wydział Biologii, Uniwersytetu Warszawskiego)

Aktywacja rozwoju zarodkowego ssaków



Środa, 14 listopada 2007, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Aleksandra Nowicka (Instytut Fizyki PAN)

Identyfikacja genów cech ilościowych QTL (Quantitative Trait Loci) u jabłoni



Środa, 24 października 2007, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Jerzy Pełka (Instytut Fizyki PAN)

Promieniowanie synchrotronowe w biologii i medycynie



Środa, 17 października 2007, godz. 15:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

mgr Szymon Niewieczerzał (Instytut Fizyki PAN)

Stan przejściowy dla zwijania się białek w prostych modelach teoretycznych



Środa, 3 października 2007, godz. 15:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

mgr Izabela Rutkowska-Włodarczyk (Instytut Fizyki PAN)

Spektrometria mas w proteomice: od proteomiki różnicowej i szukania biomarkerów do badania struktur białkowych



Wtorek, 18 września 2007, godz. 14:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Prof. Roy L. Johnston (School of Chemistry, University of Birmingham, UK)

Applications of Natural Computing to the Protein Folding Problem
(Genetic algorithms, ant colony optimization, artificial immune algorithms)




Poniedziałek, 21 maja 2007, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

mgr Grzegorz Chojnowski
(Zakład Biofizyki, Instytut Fizyki Doświadczalnej UW i Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie)

Silne i najsilniejsze sygnały w obrazach dyfrakcyjnych kryształów białek



Poniedziałek, 7 maja 2007, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. dr hab. Robert Holyst (Instytut Chemii Fizycznej PAN)

Dyfuzja i lepkość w zatłoczonym środowisku od skali nano do skali makro



Poniedziałek, 16 kwietnia 2007, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

doc. dr hab. Dariusz Stepkowski (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Rozważania teoretyczne na temat amyldoidogenezy białka prionowego



Poniedziałek, 2 kwietnia 2007, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Anna Gambin (Instytut Informatyki Uniwersytetu Warszawskiego)

Stochastyczne modelowanie w analizie danych proteomicznych



Poniedziałek, 26 marca 2007, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

doc. dr hab. Krystyna Kolwas (Instytut Fizyki PAN)

Światło jako narzędzie w badaniach przemian energetycznych w mitochondriach plemnikowych



Poniedziałek, 19 marca 2007, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Aleksandra Nowicka (Instytut Fizyki PAN)

Tablice częstości podstawień aminokwasowych PAM w kontekście analiz filogenetycznych genomów bakteryjnych



Poniedziałek, 12 marca 2007, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Paweł Daniluk (CD Bioexploratorium, Wydział Fizyki UW)

Lokalne deskryptory struktur białkowych. Wprowadzenie teoretyczne oraz zastosowania do analizy i przewidywania struktury



Poniedziałek, 19 lutego 2007, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Krzysztof Pawłowski (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Zastosowania bioinformatyki w przemyśle faramceutycznym - poszukiwanie nowych genów docelowych dla leków



Poniedziałek, 22 stycznia 2007, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Agnieszka Podlaska (IBB PAN)

Rola proteasomu w odpowiedzi komórek eukariotycznych na uszkodzenia DNA



Poniedziałek, 8 stycznia 2007, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

prof. Danek Elbaum (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Mechanizmy toksyczności beta-amyloidu



Poniedziałek, 18 grudnia 2006, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Antoni Zwiefka (Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN, Wrocław)

Metoda selekcji bibliotek fagowych w badaniach struktury i funkcji białek



Poniedziałek, 11 grudnia 2006, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Dorota Szczepankowska (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Wpływ palmitoilokarmityny na zmiany struktury błony komórkowej



Poniedziałek, 4 grudnia 2006, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Wojciech Karlowski (UAM Poznań)

Greenformatics: wybrane metody poznania i analizy genomów roślinnych



Poniedziałek, 13 listopada 2006, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr inż. Justyna Barańska (Instytut Fizyki, Politechnika Poznańska)

Ewolucja konformacji i parametrów węzłów zaciskanych na idealnej linie



Poniedziałek, 6 listopada 2006, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

mgr. Michał Boniecki (Wydział Chemii UW)

Ciągły i pośredniej rozdzielczości model białka - Refiner: konstrukcja i zastosowania



Poniedziałek, 16 października 2006, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr Michał Wojciechowski (Instytut Fizyki PAN)

Wpływ ciśnienia na oddziaływania wewnątrzcząsteczkowe w ramach gruboziarnistych modeli Go



Poniedziałek, 2 października 2006, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr Piotr Szymczak (Instytut Fizyki Teoretycznej Uniwersytetu Warszawskiego)

Rozciąganie i zwijanie białek pod wpływem stałej siły



Poniedziałek, 22 maja 2006, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr Dominik Gront (Wydział Chemii Uniwersytetu Warszawskiego)

Wybrane aspekty modelowania białek w zredukowanej przestrzeni konformacyjnej



Poniedziałek, 24 kwietnia 2006, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

mgr Bartosz Różycki (IT UW)

Adhezja błon z aktywnymi składnikami



Poniedziałek, 03 kwietnia 2006, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr hab. Andrzej Kloczkowski (Iowa State University)

Przewidywanie struktury drugorzędowej białek



Seminarium specjalne

Czwartek, 23 marca 2006, godz. 14:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr. TOBIAS HENZLER (Bio-Logic - Science Instruments SA, F-38640 Claix, France)

Introduction to the Stopped-flow Technique - Principles and Instrumentation



Poniedziałek, 20 marca 2006, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Joanna Trylska (ICM UW)

Właściwości elektrostatyczne i dynamika rybosomu bakteryjnego



Poniedziałek, 27 lutego 2006, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

dr Michał Wojciechowski (Instytut Fizyki PAN)

Uogólniony model Borna - zalety i wady uproszczonego rozwiązywania Poissona-Boltzmanna



Poniedziałek, 20 lutego 2006, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Tomasz Lipniacki (IPPT PAN)

Stochastyczna regulacja wczesnej odpowiedzi immunologicznej: Model NF-kappaB



Poniedziałek, 16 stycznia 2006, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Jan Karbowski (California Institute of Technology)

Fizyczne i biologiczne zasady funkcjonowania mozgu: od robakow C Elegans do ssakow



Poniedziałek, 09 stycznia 2006, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Barbara Wawro (Instytut Biologii Doswiadczalnej PAN i University of Medicine and Dentistry of New Jersey, USA)

Regulacja polimeryzacji aktyn w komórkach: forminy



Poniedziałek, 19 grudnia 2005, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Bertrand Vileno (Institute of Physics of Complex Matter, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne (EPFL))

From carbon and semiconductor nanostructures to biological targets - photo-oxidative stress



Poniedziałek, 14 listopada 2005, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

mgr Szymon Niewieczerzal (Instytut Fizyki PAN)

Symulacje procesów asocjacji guaniny z fosforylazą nukleozydów purynowych metodami dynamiki brownowskiej



Poniedziałek, 24 października 2005, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

dr Valentina Tozzini (NEST CNR-INFM i Scuola Normale Superiore, Piza, Wlochy)

Coarse-grained models for large time-scale molecular dynamics simulations



Poniedziałek, 17 października 2005, godz. 10:00
sala D, IF PAN, Al. Lotników 32/46

Dr Piotr Pawłowski (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN)

Od retikulocytu do erytrocytu



Poniedziałek, 3 października 2005, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Prof. Marek Cieplak (Instytut Fizyki PAN)

Stan przejściowy w zwijaniu się białek - model ścisły



Poniedzialek, 9 maja 2005, godz. 10:00
sala E, IBB, ul. Pawińskiego 5A

Dr Wojciech Dzwolak (Instytut Fizyki Wysokich Cisnień PAN)

O amyloidogenezie, czyli o molekularnej socjopatii białek



  prof. Marek Cieplak (IFPAN)
prof. Piotr Zielenkiewicz (IBB)