dr Beata Kliszcz
(Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN, Warszawa (obecna afiliacja: Instytut Fizyki PAN, Warszawa))

The mechanism of microtubule-pair sliding driven by kinesin-1 in vitro

Seminarium on-line

dr hab. Michał Rode
(Instytut Fizyki PAN)

Intramolecular mechanisms in photochromic organic molecules

Seminarium on-line

Prof. Krzysztof Kuczera
(Chemistry and Molecular Biosciences, University of Kansas at Lawrence)

Thermodynamics and kinetics of GB1 hairpin folding from replica-exchange and molecular dynamics simulations

Seminarium on-line

We have performed molecular dynamics (MD) and replica-exchange (REMD)simulations of folding for the 16-residue GB1 hairpin peptide in explicit solvent. REMD predicts a folded hairpin fraction of 39-41% at 320 K and a statistical folding pathway consistent with a zipper model. Based on 120 microseconds of MD trajectories at 320 K, the two slowest relaxation times were 1,800 and 170 ns, with the slower one assigned to global folding. MD trajectories also followed the zipper mechanism, with nucleation at the central turn followed by consecutive hydrogen bond formation/breaking in a highly cooperative manner. Backbone and hydrophobic sidechain aggregation were highly correlated as well. We also constructed coarse-grained kinetic models with the Optimal Dimensionality Reduction (ODR) approach. Besides the 1,800 ns folding process, additional relaxation times in the 130-170 ns range could be assigned to formation/decay of the transition state and off-path intermediates. The coil state was the most highly populated and also most heterogenous, including primarily extended and turn structures. The hairpin state was also heterogenous, , involving fully folded and partially folded in-register hairpins along the zipper pathway. The transition state corresponded to the nucleated hairpin. Overall, our simulations were in excellent agreement with experimental data on folded fraction, relaxation time and folding mechanism. Additionally, the kinetic modeling allowed identification of a nascent hairpin as a transition state for folding and a faster relaxation time of ~100 ns related to formation of off-path intermediates and the transition state.

prof. dr hab. Piotr Paneth
(Wydział Chemii Politechniki Łódzkiej)

Non-covalent isotope effects

Seminarium on-line

While isotope effects are, by the Bigeleisen equation, understood as the result of changes in force constants involving the isotopic atom, a plethora of observed isotope effects result from processes that apparently do not introduce such changes. These include secondary kinetic isotope effects, as well as isotope effects on chromatographic retention times, vapor pressure isotope effects, isotope effects on diffusion, miscibility of liquids, and many other physical processes. They are important from the practical point of view as they are used in the technological processes of isotopic enrichment that finds their place in the newest applications in nanomaterials. In this presentation, we ll provide several examples and address the origins of these phenomena from the computational point of view.

mgr Łukasz Charzewski
(Wydział Chemii, UW)

Structural characterization of MMP-9 forms and their implications for activity regulation

Seminarium on-line

prof. dr hab. Mai Suan Li
(Instytut Fizyki PAN)

Protein Folding and Dimerization on Ribosomes

Seminarium on-line

dr Maura Malińska
(Wydział Chemii UW)

Experimental Charge Density Studies in Crystals - Requirements and Possibilities

Seminarium on-line

dr Radosław Kotuniak
(Institute of Biochemistry and Biophysics PAS and Laboratory of Biological Chemistry of Metal Ions, Warszawa)

Hidden, short-lived players of biological copper transport

Seminarium on-line

prof. dr hab. Izabela Makałowska
(Instytut Biologii i Ewolucji Człowieka, Wydział Biologii, Uniwersytet im. A. Mickiewicza, Poznań)

Does genes retroposition have any purpose? Digging in the genomic recycling bin.

Seminarium on-line

RNDr. Veronika Obšilová, Ph.D.
(Institute of Physiology CAS, Laboratory of Structural Biology of Signaling Proteins, Vestec (Prague) Czech Republic)

Structural insight into the 14-3-3-dependent regulation of human Nedd4-2 ubiquitin ligase

Seminarium on-line

dr Joanna Panecka-Hofman
(Zakład Biofizyki, Wydział Fizyki UW)

The global and local dynamics of a homotetrameric folate pathway enzyme - pteridine reductase 1 - the target for anti-trypanosomatid drug design

Seminarium on-line

dr hab. Piotr Setny
(Centrum Nowych Technologii UW)

Granger causality analysis of protein beta-hairpin folding

Seminarium on-line

prof. dr hab. Jarosław Stolarski
(Instytut Paleobiologii PAN, Warszawa)

Going deep: coral biomineralization molecular toolbox along the depth gradient

Seminarium on-line

prof. dr hab. Michał Dadlez
(Instytut Biochemii i Biofizyki PAN)

Structural mass spectrometry helps to provide structures of difficult protein targets

Seminarium on-line

Dr. Tomasz Zajkowski
(Research Scientist at NASA Ames Research Center)

An Evolutionary Perspective on Prion-Based Mechanisms of Regulation and Adaptation

Seminarium on-line

prof. dr hab. Wiesław Gruszecki
(Uniwersytet Marii Curie-Skłodowskiej w Lublinie)

Why and what for is the yellow spot in your eye yellow

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/86164434048

dr Marta Pilz
(Institute of Physical Chemistry PAS)

Advanced fluorescence-based methods to study drug delivery

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/86164434048

Medical application of nanotechnology and nanomedicine is a broad field of research describing the use of nanomaterials to combat a number of diseases, including cancers. Despite the variety of approaches available, there is still a lack of strategies offering quantitative analysis to assess the suitability of new compounds or nanoparticles as potential therapeutic agents. The key issue is therefore to establish appropriate models and tools that could be applied in preclinical research to assess the advances made in nanomedicine. To address this need, I focus my research on developing new fluorescence-based methodsfor studying the transport of drugs: in tissues, through the cell membrane and inside the cell. The devised methodologies allow to measure the mobility of anyfluorescent molecule in the extracellular spaces of tumour models, the cellular uptake kineticsof drugs or drug carriers, and characterize drug-target interactions.

dr Szymon Nowakowski
(Center for Machine Learning, IDUB project, Faculty of Physics, University of Warsaw)

Protein folding using machine learning - structure and functionality of the AlphaFold service

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/86164434048

It seems that the half-century problem of protein folding has finally been largely solved. This latest breakthrough was achieved not only by gaining in-depth insight into the mechanics of protein folding, but by the very skilful use of black-box machine learning methods. This has been achieved not in academia, but in a private sector enterprise. In this seminar, due to the limited time available, I will describe the basics of the Alphafold model, leaving aside possible future surprises and consequences. Time will tell how far they can go.

dr Mateusz Kogut
(Instytut Fizyki PAN)

From full-atom simulations of non-canonical DNA to coarse-grained models predicting protein structures

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/86164434048

mgr Barbara Klepka
(Instytut Fizyki PAN)

Studies of hydrodynamic properties of coral acid-rich proteins by means of fluorescence correlation spectroscopy

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/86164434048

dr Joanna Bojarska
(Politechnika Łódzka)

Short peptides: towards smart terapies

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/86164434048

dr Kaja Moczulska
(previously at Svante Pääbo Lab, Leipzig)

Old pathway - new insights: on purine biosynthesis and human evolution

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/85986543967

Prof. Wladek Minor
(Department of Molecular Physiology and Biological Physics, University of Virginia, USA)

Rapid response to emerging biomedical challenges and threats

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

prof. Adam Liwo
(Wydział Chemii, Uniwersytet Gdanski)

The UNIfied COarse GRaiNed (UNICORN) model of biological macromolecules: principles and applications

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

dr Paweł Krupa
(Instytut Fizyki PAN)

Protein structure prediction by all-atom and coarse-grained force fields

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

dr hab. Justyna mcIntyre
(Institiute of Biochemistry and Biophysics)

Regulation of DNA damage tolerance by posttranslational protein modications

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

prof. dr hab. Bogdan Cichocki
(Institiute of Theoretical Physics, The University of Warsaw)

Diffusion coefficients of macromolecules - part II

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

prof. dr hab. Bogdan Cichocki
(Institiute of Theoretical Physics, The University of Warsaw)

Diffusion coefficients of macromolecules - part I

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

prof. Wojciech Bal
(IBB)

A revisionist perspective on copper interactions with Abeta peptides

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

mgr Radost Waszkiewicz
(IFT UW)

Shape dynamics and sedimentation coefficients of supercoiled DNA minicircles

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

CryoEM imaging of 336bp DNA minicircles by Irobalieva et al (2015) showed a diversity of attained shapes, leading to twist-dependent hydrodynamicproperties. Variability of drag coefficients of the samples curtails the use of analytic techniques (gel electrophoresis, analytic ultracentrifugation, FCS) to investigate biochemical interactions of DNA loops with enzymes. For the interpretation of experimental values, we propose a model able of capturing both elastic and hydrodynamic effects. Our two-stage approach starts with finding shapes of minimum elastic energy followed by using an overlapping bead representation to compute hydrodynamic properties. By separating the hydrodynamic and elastic consideration, we simplify the calculations considerably without compromising the accuracy.

prof. Agnieszka Chacinska
(ReMedy International Research Agenda Unit, University of Warsaw, and International Institute of Molecular Mechanisms and Machines (IMol) PAS)

Protein homeostasis in the cell: the case of mitochondria

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

dr Mateusz Sikora
(Max Planck Institute of Biophysics Frankfurt and Physics Department University of Vienna)

In situ structural analysis of SARS-CoV-2 spike reveals flexibility mediated by three hinges

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) spike protein mediates viral entry to the host cells and initiates the infection. As the only exposed surface protein, it is a primary target for vaccine development. We combined cryo-electron tomography, subtomogram averaging, and molecular dynamics simulations to visualise and structurally characterise spike proteins on the surface of intact virions. We discover three hinges in the stalk of S protein that endow it with surprising flexibility and can be relevant in the process of binding to the surface of the host cell.

prof. dr hab. Mai Suan Li
(Instytut Fizyki PAN)

COVID-19: A Computational Study

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

dr hab. Alek Bartnik
(Instytut Fizyki Teoretycznej, Wydział Fizyki UW)

Phenomenological models of the COVID-19 pandemic. Use of correlated data

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

dr Szymon Kubiszewski-Jakubiak
(Instytut Fizyki PAN)

Metabolic Engineering of Source and Sink Tissues for Improved Tomato Crop Yield

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

dr Angana Ray
(Instytut Fizyki PAN)

Computational biophysical studies on protein and protein-nucleic acid complexes

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

prof. dr hab. Jarosław Poznański & dr hab. Marcin Grynberg
(Instytut Biochemii i Biofizyki PAN)

How to measure mean force of evolution?

Seminarium on-line: https://zoom.us/j/92872650351

prof. dr hab. Jarosław Poznański
(IBB)

How to measure mean force of evolution?
SEMINARIUM ODWOŁANE

prof. Marek Tchórzewski
(Wydział Biologii i Biotechnologii UMCS, Lublin)

Interplay between the ribosome and ricin - insight into ricin toxicity

prof. dr hab. Anna Filipek
(Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Calcium, Ca²⁺ - binding proteins and Ca²⁺ -signaling

prof. Joanna Trylska
(CENT UW)

Vitamin B12 as a carrier of modified oligonucleotides to bacterial cells

dr hab. Honorata Czapińska
(IIMCB)

Molecular mechanisms of protein-DNA interactions. How do restriction-modification systems select their targets?

Dr. Lukas Stelzl
(Max Planck Institute of Biophysics, Frankfurt, Germany)

From resolving disordered proteins with atomic resolution to understanding liquid-liquid phase separation in biology

dr Monika Wasilewska
(Jerzy Haber Institute of Catalysis and Surface Chemistry, PAN, Kraków)

Properties of fibrinogen monolayers at solid substrates - conformations, stability and interactions with colloid ligands

dr. hab. Sylwia Rodziewicz-Motowidło, prof. UG
(IBB PAN, Warszawa, Faculty of Chemistry, Department of Biomedical Chemistry, University of Gdańsk)

Human Cystatin C - protein with many faces

dr hab. Jacek Czub
(Department of Physical Chemistry, Gdańsk University of Technology)

Exploring mechanisms of protein-protein and protein-DNA recognition through atomistic simulations

dr hab. prof. Ewa A. Grzybowska
(Zakład Onkologii Molekularnej i Translacyjnej, Centrum Onkologii-Instytut, Warszawa)

HAX1: intrinsically disordered RBP which interacts with mitochondrial chaperones

dr Giovanni La Penna
(National Research Council of Italy, Firenze)

Role of metal ions in disordered biological systems: a modelling perspective

prof. Elżbieta Kierzek
(Instytut Chemii Bioorganicznej PAN, Poznań)

Influenza virus. RNA secondary structure as a target for new antiviral therapies

mgr Łukasz Charzewski
(Wydział Fizyki, UW)

MMP9, a key player in many physiological and pathological processes, and its regulatory complexes with the TIMP-1 inhibitor

prof. Jonathan Heddle
(Malopolska Centre of Biotechnology, UJ, Kraków)

Building Artificial Protein Cages with Paradoxical Geometry

Anna Szymaniec-Rutkowska
(IBB)

Partial molar volume - new experimental measure of hydrophobicity

mgr Maciej Ciemny
(Wydział Fizyki i Wydział Chemii UW)

The use of a coarse-grained CABS statistical force field to simulate the flexibility of proteins and to predict structures of their complexes with peptides

dr Adolfo Poma
(IPPT PAN)

Comparative study on the nanomechanics/thermodynamics of neurodegenerative fibrils through simulation

dr Marcin Płodzień
(Instytut Fizyki PAN)

Ultra-cold atoms in optical lattice as a Quantum Simulator for energy transportation in alpha-helix proteins

prof. Wojciech Bal
(IBB, Warszawa)

A good Aβ? Bioinorganic perspective on the toxicity and physiological role of beta-amyloid peptide

mgr Łukasz Mioduszewski
(Instytut Fizyki PAN)

Disordered peptide chains in an alpha-C-based coarse-grained model

dr Katarzyna Szot-Karpińska
(IChF, Warsaw)

Nobel in Chemistry 2018 - Optimizing the evolution, and the research from our own backyard

dr hab. Marta Kopaczyńska
(Department of Biomedical Engineering, Wrocław University of Science and Technology)

Optical manipulation: from nanomolecules to single cells

dr Vineet Gaur
(International Institute of Molecular and Cell Biology, Warszawa)

Structural and mechanistic analysis of Slx1-Slx4 endonuclease

dr Dorota Niedziałek
(IBB PAN, Warszawa)

Dissociation of amyloid aggregates with photoswitchable molecular levers

dr Paweł Krupa
(Instytut Fizyki PAN)

Disulfide bonds in molecular modeling studies of proteins

dr hab. Maciej Figiel
(Instytut Chemii Bioorganicznej PAN, Poznań)

Identification of new neurodegeneration mechanisms using mouse models and stem cells

prof. dr hab. Elżbieta Zipper
(Instytut Fizyki Uniwersytetu Śląskiego, Katowice)

Fizycy w badaniach nowotworów

prof. dr hab. Sławomir Filipek
(Wydział Chemii, UW)

G-protein-coupled receptors - novel structures and activation route

dr hab. Arkadiusz Ptak
(Wydział Fizyki Technicznej, Politechnika Poznańska)

Single-molecule force spectroscopy: experiments, simulations, theoretical models

dr Maja Cieplak-Rotowska
(CENT-UW)

Biophysical and molecular biology studies of proteins involved in gene silencing

dr hab. inż. Joanna Niedziołka-Jonsson
(Instytut Chemii Fizycznej PAN)

Engineering surfaces for (bio)sensor applications

prof. dr Danek Elbaum
(Instytut Fizyki PAN)

Nie tylko o nauce

prof. Zofia Drzazga
(Zakład Fizyki Medycznej, Instytut Fizyki US, Chorzów)

Can functional connectivity maps (rs-fMRI) replace functional magnetic resonance imaging (fMRI)?

prof. Tomasz Lipniacki
(IPPT Warszawa)

Antyviral innate immune responses are regulated in the crosstalk of three transcription factors

prof. Agnieszka Bzowska
(Wydział Fizyki Uniwersytetu Warszawskiego)

Structural and biochemical characterization of purine nucleoside phosphorylase from Helicobacter pylori

prof. Ewa Górecka
(Wydział Chemii Uniwersytetu Warszawskiego)

Chiral structures made of non-chiral molecules

dr Dawid Walerych
(Instytut Medycyny Doswiadczalnej i Klinicznej im. M. Mossakowskiego PAN)

Multi-omics data integration in functional cancer research

dr Mateusz Sikora
(Institute of Science and Technology, Austria)

Cell-cell contacts at micro- and nano-scale

Dr. Yonggang Liu
(Changchun Institute of Applied Chemistry, Chinese Academy of Sciences Changchun, China)

Spontaneous tubulation of giant vesicles in contact with multiple aqueous phases

Prof. Thanyada Rungrotmongkol
(Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand)

Molecular dynamics behaviors of substrate and oseltamivir binding into viral influenza neuraminidases

dr Paweł Barmuta
(Instytut Systemów Elektronicznych, Wydział Elektroniki i Technik Informacyjnych Politechniki Warszawskiej)

Microwave applications in microbiology - beyond spectroscopy

dr Yani Zhao
(Instytut Fizyki PAN)

Proteins at air-water interfaces

dr hab. Beata Wielgus-Kutrowska
(Zakład Biofizyki, Wydział Fizyki UW)

Homooligomeric enzymes - facts and artifacts

dr Maciej Maciejczyk
(Uniwersytet Warminsko-Mazurski)

DNA-duplex formation with physics-based coarse-grained model

Prof. Michael Farle
(Universitat Duisburg-Essen, Germany & Immanuel Kant Baltic Federal University, Kaliningrad, Russia)

Functionalized Hybrid Nanomagnets: New Materialsfor Innovations in Energy Storage and Medical Theranostics

dr hab. Dariusz Plewczynski
(Laboratorium Genomiki Strukturalnej i Funkcjonalnej, CENT, UW)

Data-driven computational modeling of three-dimensional human genome architectur

dr Olaf Morawski
(Instytut Fizyki PAN)

The direct photocatalytic partial water oxidation - the new approach to water splitting

prof. dr hab. Jarosław Poznański
(IBB PAN)

Thermodynamic contribution of halogen bonding in protein-ligand complexes

Dr. Rocco Caliandrio
(Institute of Crystallopgraphy, CNR, Bari, Italy)

New tools and techniques for investigating protein structural dynamics

Prof. Jarosław Poznański
(IBB PAN)

Wiązanie halogenowe w układach białko-ligand

mgr Mateusz Chwastyk
(Instytut Fizyki PAN)

Topological changes in knotted proteins

Dr. Eugene P. Petrov
(Max Planck Institute of Cellular and Molecular Biophysics, Martinsried near Munich, Germany)

Macromolecules and colloids on lipid membranes: Brownian motion, conformational dynamics, and membrane-driven self-organization

Dr. Giovanni La Penna
(Istituto di Chimica dei Composti OrganoMettallici CNR, Sesto Fiorentino, Italy)

Ions and disordered proteins

dr Adolfo Poma
(Instytut Fizyki PAN)

Computational Model for Native Cellulose I and the Transformation Pathways for I-alpha to I-beta Transitions

dr Anna Ajduk
(Wydział Biologii UW)

Optical Coherence Microscopy: a novel non-invasive method for visualisation of intracellular architecture and dynamics

dr hab. prof. UW Wojciech Dzwolak
(Wydział Chemii UW)

(Very) Fast Self-Assembly of Amyloid Fibrils

prof. dr hab. Jan Antosiewicz
(Wydział Fizyki UW)

UV-Vis spectroscopy of tyrosine side-groups in studies of protein structure

mgr Maciej Wojcikowski
(IBB, Warszawa)

Performance of machine learning scoring functions in virtual screening

Prof. Jonas Schartner
(Department of Biophysics, Ruhr-University Bochum, Germany)

Germanium catches proteins in action

dr Paweł Szczęsny
(IBB, Wydział Biologii UW)

Ribosomal hiccups - gene expression regulation by polyadenine tracks in coding regions

Prof. Jarosław Stolarski
(Instytut Geologii PAN, Warszawa)

Coral biomineralization and the global climate change

mgr Izabela Kamińska
(Instytut Fizyki PAN, Warszawa)

Nanostruktury tlenkowe do obrazowania in vitro

dr Piotr Setny
(Centrum Nowych Technologii UW, Warszawa)

Hydratation in discrete water: from bulk free energies to localised water molecules

dr Krzysztof Sozański
(Instytut Chemii Fizycznej PAN, Warszawa)

How to break a molecular motor: A study of kinesin motion in a crowded environment

dr Dorota Niedzialek
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej, Warszawa)

The idea of a molecular lever mechanically dissociating neurotoxic assemblies of alpha-synuclein

Dr. Andrzej Kulik
(Ecole Polytechnique Federale Lausanne, Szwajacaria)

Nanoscale Infrared Spectroscopy: applications in biology of LHCII proteins and amyloids

dr Adolfo B. Poma
(Instytut Fizyki PAN)

Rare events in biophysics: how to accelerate molecular dynamics

prof. Maciej Garstka
(Wydział Biologii, UW)

Zmienność struktury błon tylakoidów roślin wyższych

dr Elżbieta Pedziwiatr-Werbicka
(Wydział Biologii, Uniwersytet Łódzki)

Nanocząstki jako wektory w terapii genowej - badania in vitro

dr Katarzyna Milowska
(Wydział Biologii, Uniwersytet Łódzki)

Dendrymery jako potencjalne leki w chorobie Parkinsona

mgr Joanna Starzyk
(Instytut Fizyki UMCS, Lublin)

Badanie samoorganizacji antybiotyku amfoterycyny B metodami spektroskopii molekularnej

Prof. Robert Szoszkiewicz
(Department of Physics, Kansas State University, Manhattan, KS, USA)

Stiffness and internal friction of single protein molecules: AFM studies

Dr. Panagiotis Theodorakis
(Imperial College, London)

Self-assembly of DNA-coated colloids

dr Michał Wojciechowski
(Instytut Fizyki PAN)

Unfolding of proteins by the proteasome in a coarse-grained model

dr hab. Szymon Kaczanowski
(IBB)

Why males are in such a rush?

dr Anna Ochab-Marciniak
(Instytut Chemii Fizycznej PAN)

Transcription factor binding as a nonlinear noise filter

dr Remigiusz Worch
(Instytut Fizyki PAN)

The influenza virus fusion peptide studied in artificial membarne systems

Dr Evzen Boura
(Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Academy of Sciences the Czech Republic, Prague, Czech Republic)

Crystal structures of Phosphatidylinositol 4-Kinases

Dr. Rocco Caliandro
(Institute of Crystallography, National Research Council of Italy, Bari, Italy)

New algorithms for protein dynamics studies and their applications to protein crystallography

dr Bartosz Różycki
(Instytut Fizyki PAN)

Spontaneous curvature of bilayer membranes: Asymmetric lipid densities and asymmetric adsorption

Angel Gomez-Scilia
(Protein Nanomechanics Lab, Cajal Institute, CSIC, Madrid, Spain)

The secret life of intrinsically disordered proteins

prof. Wiesław Nowak
(Instytut Fizyki Mikołaja Kopernika)

Single molecule nanomechanics from computational point of view: saccharides, proteins and DNA

dr Łukasz Rok
(Schaefer Technologie GmbH, Langen, Niemcy)

Mikroskop sił atomowych FluidFM wykorzystujący sondy z otwartym zakończeniem (np. do pomiaru adhezji)

mgr Mateusz Chwastyk
(Instytut Fizyki PAN)

Białka z wnękami i węzłami w modelach gruboziarnistych

dr hab. Piotr Bednarczyk
(Katdera Fizyki SGGW)

Strukturalne i funkcjonalne sprzężenie mitochondrialnego kanału BKCa z łańcuchem oddechowym

prof. nzw. dr hab. Artur Zdunek
(Instytut Agrofizyki PAN, Lublin)

Struktura i funkcja ściany komórkowej (w tym pektyn, hemicelulozy i celulozy) roślin

prof. dr hab. Wiesław Gruszecki
(Zakład Biofizyki, UMCS Lublin)

Racjonalna choć nie planowa gospodarka wzbudzeniami elektronowymi w roślinach

dr Adriana Palińska-Saadi
(Instytut Fizyki PAN)

Sitodrukowane czujniki elektrochemiczne w badaniach oddziaływań DNA z błekitem metylenowym, antracyklinami i ich formamidynowymi pochodnymi

Prof. Fernando Luis Barroso da Silva
(Department of Physics and Chemistry, Faculty of Pharmaceutical Sciences at Riberao Preto - University of Sao Paulo, Brazylia)

Molecular modeling of protein complexes driven by electrostatic interactions with interest for industries and biosciences

dr hab. Szymon Kaczanowski
(IBB)

Samobójstwa jednokomorkowców

prof. dr hab. Marek Cieplak
(Instytut Fizyki PAN)

Krajobrazy energetyczne białek w modelach sieciowych

dr Grzegorz Chwastek
(Instytut Fizyki PAN)

Fluorescence techniques in studies of lipid monolayers

dr Grzegorz Wieczorek
(IBB)

Symulacje ludzkiej paraoxonazy 1

dr Artur Podhorodecki
(Instytut Fizyki Politechniki Wrocławskiej)

Synteza oraz optyczne właściwości nanokryształów fluorkowych domieszkowanych jonami ziem rzadkich do zastosowań w medycynie i biologii

dr Bartosz Rożycki
(Instytut Fizyki PAN)

Adhezja błon komórkowych - efekty kooperatywnego wiązania receptorów adhezyjnych i tworzenia domen w synapsie immunologicznej

dr Bartosz Rożycki
(Instytut Fizyki PAN)

Adhezja błon komórkowych - efekty kooperatywnego wiązania receptorów adhezyjnych i tworzenia domen w synapsie immunologicznej

dr inż. Michał J. Wozniak
(Wydział Inżynierii Materiałowej, Polietchnika Warszawska)

Mikroskop AFM jako narzędzie w badaniach biomateriałów dla potrzeb inżynierii tkankowej oraz narzędzie wspomagające ocenę toksyczności nanomateriałów

Prof. Ewa Goldys
(MQ BioFocus Research Centre, Mcquarie University, Sydney, Australia)

Nanoparticle bioprobes for advanced bioimaging and biosensing

dr Eun-ju Lee
(Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO), Clayton, Australia)

Surface Chemistry Tool for Cell Biology

dr Agata Świątkowska
(Instytut Chemii Bioorganicznej, Poznań)

Struktura końca 5 p53 mRNA i jego funkcja w translacji białka p53 i jego delta N-izoformy

dr Joanna Sułkowska
(Wydział Chemii UW)

Przewidywanie struktury białek w oparciu o genomikę

dr Artur Podhorecki
(Politechnika Wrocławska, Laboratorium Spektorskopii Optycznej i Nanostruktur)

Synteza oraz optyczne właściwości nanokryształów fluorkowych domieszkowanych jonami ziem rzadkich do zastosowań w medycynie i biologii

prof. dr hab. Wojciech Bal
(IBB)

Cała prawda o pH

prof. dr hab. Jolanta Zakrzewska-Czerwińska
(Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii)

Dynamika organizacji chromosomu bakteryjnego

prof. dr hab. Jolanta Redowicz
(Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Miozyny - motory cytoplazmatyczne i jądrowe

dr Joanna Grzyb
(Instytut Fizyki PAN)

Nanostruktury hybrydowe o aktywności enzymatycznej

prof. dr hab. Sławomir Filipek
(Wydział Chemii UW)

Receptory błonowe GPCR: struktury i mechanizmy aktywacji. Nobel 2012

Dr. Ellinor Haglund
(University of California San Diego)

The unique cysteine knot regulates the pleotropic hormone leptin

dr Bartosz Rożycki
(Instytut Fizyki PAN)

Konformacje białek wielodomenowych i kompleksów białkowych badane przy użyciu połączenia symulacji molekularnych z doświadczeniami SAXS, EPR, FRET i NMR

dr hab. Marcin Grynberg
(IBB)

Ewolucja białek wielodomenowych

mgr Anna Baranowska-Korczyc
(Instytut Fizyki PAN)

Od nanowłókien po bioczujniki, czyli o materiałach elektroprzędzonych i ich zastosowaniu

prof. Joanna Trylska
(Centrum Nowych Technologii UW)

Oddziaływania antybiotykąw z RNA rybosomu

dr Beata Myśliwa-Kurdziel
(Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii, UJ)

Protochlorofilid jako substrat zależnej od światła oksydoreduktazy

prof. dr hab. Andrzej Jerzmanowski
(IBB i Wydział Biologii UW)

Lokalna i globalna funkcja białek strukturalnych w chromosomach

What is Life?

dr Michał Bystrzejewski
(Wydział Chemii UW)

Magnetyczne hybrydowe nanomateriały węglowe: otrzymywanie, właściwości, zastosowania

Prof. Marek Kimmel
(Department of Statistics, Rice University, Houston, TX)

Cell cycle regulation, homeostasis, switches and stochasticity: some questions

dr Nathalie Reuter
(Uniwersytet w Bergen, Norwegia)

Interfacial binding sites of peripheral membrane proteins: insights from computations and experiments

dr Bohdan Paterczyk
(Pracownia Mikroskopii Elektronowej i Konfokalnej, Wydział Biologii UW)

SAIVI - przyżyciowa analiza lokalizacji nanokryształów fluorescencyjnych w małych zwierzętach laboratoryjnych

dr Beata Hat
(IPPT)

Oscylacje i bistabilność w ukladzie regulatorowym p53

mgr Bożena Sikora
(Instytut Fizyki PAN)

Strategie projektowania biosensorów połprzewodnikowych do zastosowań w biologii i medycynie

dr hab. prof. Mariusz Gagos
(Wydział Biologii i Biotechnologii UMCS i Zakład Biofizyki Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie)

Spektroskopowe i strukturalne badania organizacji molekularnej antybiotyku amfoterycyny B w układach biologicznych

dr Anna Ajduk
(Wydział Biologii UW)

Dynamika cytoplazmy jako nowy wskaźnik oceny potencjału rozwojowego zarodków ssaków

Prof. Massimo Vassalli
(Instytut Biofizyki, Uniwersytet Florencki, Włochy)

Multiscale characterization of a chimeric biomimetic polypeptide for stem cells scaffolding

Seminarium promocyjne projektu NanoFun współfinansowanego ze środków UniiEuropejskiej w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka

prof. dr hab. Andrzej Huczko
(Wydział Chemii UW)

Otrzymywanie nanomateriałów na drodze wysokoenergetycznej aktywacji reagentów

prof. dr hab. Jan Antosiewicz
(Zakład Biofizyki, Wydział Fizyki UW)

Oddziaływania hydrodynamiczne w kinetyce asocjacji molekul: obserwacje tworzenia kompleksów lizozymu z N, N', N''-triacetylo chitotrioza w spektrometrze zatrzymanego przepływu

prof. Matthias Bochtler
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej, IBB)

Three lectures on the proteasome: III. The redulatory particle, the control unit of proteasome

prof. Matthias Bochtler
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej, IBB)

Three lectures on the proteasome: The core particle, the catalytic engine of the proteasome

prof. Matthias Bochtler
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej, IBB)

Three lectures on the proteasome: I. Protein degradation in eukaryotes

dr hab. Mikolaj Olejniczak
(Wydział Biologii, Uniwersytet im. Mikołaja Kopernika, Poznań)

Białka opiekuńcze RNA u bakterii

dr Remigiusz Worch
(Instytut Fizyki PAN)

Dlaczego warto badać białka błonowe w błonie?
O tworzeniu kompleksów przez receptor interleukiny-4

Dr. M. Miller
(National Cancer Institute,USA)

Structural Insights into of Transcription Factor C/EBPbeta

dr Paweł Daniluk
(Zakład Biofizyki UW i Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN)

Porównywanie struktur przestrzennych białek

prof. nzw. dr hab. Leonora Bużańska
(Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN)

Decyzje rozwojowe komórek macierzystych w środowisku biomimicznym

dr Paweł Daniluk
(Zakład Biofizyki UW i Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN)

Porównywanie struktur przestrzennych białek
Seminarium odwołane.

prof. Janusz Bujnicki
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej)

New tools for RNA 3D structure modeling: inspirations from the protein world

mgr Oliwia Szklarczyk
(Department of Chemistry and Applied Biosciences, ETH Zurich)

Simulations of crystals: revelations and traps of amyloid fibrils molecular dynamics

dr Krystiana Krzyśko
(Zakład Biofizyki, Wydział Fizyki, UW)

Topoizomeraza 1 i i jej enzymatyczna aktywność kinazowa - badania z wykorzystaniem metod molekularnego modelowania i bioinformatyki

prof. dr hab. Krzysztof Lewiński
(Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego)

Wysokie ciśnienie w badaniach strukturalnych makroczastek

prof. Alexandre Morozov
(Department of Physics and Astronomy, Rutgers University, USA)

Biophysical models of chromatin structure and energetics

dr Michał Wojciechowski
(Instytut Fizyki PAN)

Zachowanie białek w ograniczonej przestrzeni i w warunkach tłoku molekularnego - rola oddziaływań hydrodynamicznych

dr hab. Izabela Makałowska
(Wydział Biologii UAM, Poznań)

Retropozycja - niedoceniony naped ewolucji

Dr Jarosław Majewski
(Manuel Lujan Jr. Neutron Scattering Center, Los Alamos National Laboratory)

Probing the Structure and Stability of Lipid Rafts

prof. dr hab. Andrzej Dobek
(Wydział Fizyki UAM, Poznań)

Przeniesienie energii wzbudzenia i elektronu w błonach bakterii fotosyntetycznych i roślin zielonych modyfikowanych fizyko-chemicznie i genetycznie

dr hab. Piotr Szymczak
(Instytut Fizyki Teoretycznej Wydziału Fizyki UW)

Zmiany konformacji białek pod wpływem siły okresowej

prof. Marta Pasenkiewicz-Gierula
(Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii, UJ)

Cholesterol w soczewce oka - postulowana funkcja

dr hab. Tomasz Ciach
(Wydział Inżynierii Chemicznej i Procesowej PW)

Inżynieria biomedyczna: implanty i systemy podawania leków

dr Artur Krężel
(Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Wrocławskiego)

Sondy fluorescencyjne w badaniach homeostazy cynku

dr Jakub Włodarczyk
(Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Metody mikroskopii konfokalnej, bazujące na zjawisku fluorescencyjnego rezonansowego przeniesienia energii, do badania oddziaływania białko-białko

mgr Marlena Siwiak
(IBB PAN)

Opis translacji w czasie dla wszystkich białek komórki

dr Remigiusz Worch
(Biophysics Group, Biotec, Technical University, Dresden)

Fluktuacje pod mikroskopem - spektroskopia korelacji fluorescencji

prof. dr hab. Andrzej Sobolewski
(Instytut Fizyki PAN)

Fizyka wiązania wodorowego: od teorii do bio-inspirowanych zastosowań

dr hab. Jarosław Poznański
(IBB PAN)

Badania strukturalne białek rozwiniętych

dr Paweł Szczęsny
(Wydział Biologii UW i IBB)

Trimeryczne adhezyny autotransportowe: relacje sekwencja-struktura w układach trimerycznych

prof. Jarosław Stolarski
(Instytut Paleobiologii PAN, Warszawa)

Ślady życia w kamieniu, czyli o wpływie organizmów na mineralizacje szkieletu

prof. dr hab. Jan Antosiewicz
(Zakład Biofizyki IFD, UW)

Protonacyjne stopnie swobody w konformacyjnych przejściach białek indukowanych przez zmiany pH

dr hab. Tomasz Lipniacki
(IPPT)

Aktywacja limfocytu B: równania reakcji-dyfuzji dla kaskady kinaz

prof. dr hab. Andrzej Koliński
(Wydział Chemii UW)

Wieloskalowe modelowanie białek

dr Maciej Długosz
(ICM UW)

Symulacje dynamiki molekularnej N-terminalnych fragmentów huntingtyny. Konsekwencje dla agregacji.

prof. dr hab. Maciej Żylicz
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej)

Udział białek opiekuńczych w zwijaniu się innych białek

dr Agnieszka Chacińska
(Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej)

Jak zbudować mitochondria?

dr Aleksandra Walczak
(Princeton University, USA)

Przetwarzanie informacji w małych układach regulujących ekspresję genów

dr Joanna I. Sułkowska
(Instytut Fizyki PAN & University of California San Diego)

Omijanie kryzysu w zwijaniu się białek z węzłami

prof. Wiesław Nowak
(UMK, Toruń)

Komputerowe badania nanomechaniki biopolimerów - białka macierzy zewnątrzkomórkowej

dr Thomas Weikl
(Max Planck Institute of Colloids and Interfaces, Potsdam, Niemcy)

Folding, binding and adhesion: statistical-physical models of proteins

prof. Tomasz Kowalewski
(IPPT)

Mikroprzepływy: narzędzie diagnostyki i manipulacji w naukach biomedycznych

dr Harald Janovjak
(Department of Molecular and Cell Biology, UC Berkeley, USA)

Controlling membrane protein structure and function

dr Joanna Grzyb
(Instytut Fizyki PAN)

Białka projektowane de novo (makiety białkowe) w badaniach białek z centrami żelazo-siarkowymi i hemem

dr Borys Wróbel
(Grupa Biologii Obliczeniowej, Instytut Oceanologii PAN, Sopot)

Ewolucja sieci genowych regulujacych sztuczną embriogenezę w trójwymiarowej przestrzeni z symulowaną fizyką

Dr Andriy Kryshtafovych
(Protein Structure Prediction Center, University of California at Davis)

CASP - A driving force in protein structure prediction

Dr Torgeir Hvidsten
(Umea Plant Science Center
Umea University and Swedish University of Agricultural Sciences)

A systems biology approach to model the transcriptional network in trees

dr Marcin Grynberg
(Instytut Biochemii i Biofizyki PAN)

Aerolysins: a family update

prof. Ryszard Stolarski
(Zakład Biofizyki, Wydział Fizyki, UW)

Wielofunkcyjne białko CBC - dynamika wiązania końca 5' mRNA

dr hab. Sebastian Maćkowski
(Wydział Fizyki, Uniwersytet im. Mikolaja Kopernika w Toruniu)

Spektroskopia fluorescencyjna pojedyńczych kompleksów fotosyntetycznych

dr Beata Kutrowska
(Zakład Biofizyki, Wydział Fizyki, UW)

Green Fluorescent Protein (GFP) - Nagroda Nobla z Chemii 2008

prof. Mirosław Dudek
(Uniwersytet w Zielonej Górze)

Nanocząstki magnetyczne w nano-biomateriałach

prof. Joanna Kufel
(Wydział Biologii, UW)

Wszystkie RNA duże i małe

prof. Zofia Szweykowska-Kulińska
(Wydział Biologii, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza)

Biogeneza roslinnych mikro-RNA i nowe aspekty regulacji ekspresji genów

mgr Julia Romanowska
(ICM UW)

Własności miejsca wiążacego antybiotyki aminoklikozydowe w rybosomie

dr Aleksandra Wysłouch-Cieszyńska
(Instytut Biochemii i Biofizyki PAN)

S-nitrozylacja cystein - jedna z ważnych modyfikacji potranslacyjnych białek

mgr Zuzanna Szymańska
(ICM UW)

Indukcja białek szoku termicznego i ich udział w inicjowaniu procesów nowotworowych

dr Tadeusz Kosztolowicz
(Instytut Fizyki, Uniwersytet Jana Kochanowskiego, Kielce)

Subdyfuzyjny model rozwoju prochnicy

mgr inz. Rafał Biedrzycki
(Wydział Elektroniki i Technik Informacyjnych PW)

Konstruktywna indukcja w zadaniu klasyfikacji sekwencji DNA

prof. dr hab. Teresa Zołądek
(Instytut Biochemii i Biofizyki PAN)

Udział ligazy ubikwitynowej Rsp5/Nedd4 w transporcie białek i organizacji cytoszkieletu aktynowego u drożdży S. cerevisiae

dr hab. Wojciech Dzwolak
(Wydział Chemii UW)

Chiralna bifurkacja - nowe zjawisko w misfoldingu i agregacji białek

dr hab. Paweł Pomorski
(Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Cytoszkielet a homeostaza wapniowa

Prof. Krzysztof Kuczera
(University of Kansas at Lawrence, Department of Chemistry and Department of Molecular Biosciences)

Simulation of peptide folding kinetics with milestoning

dr Anna Niedźwiecka (Instytut Fizyki PAN)

Pare uwag o komunikacji konców 5' i 3' w metabolizmie eukariotycznego mRNA

dr Radoslaw Przeniosło (Instytut Fizyki Doświadczalnej UW)

Własności strukturalne i termiczne biogenicznego CaCo₃ - badania szkieletów koralowców

prof. dr hab. Marta Pasenkiewicz-Gierula (Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii, UJ, Kraków)

Jak białko kotwiczy sie w błonie

dr Jacek Jaworski (IIMCB, Warszawa)

mTOR - wielofunkcyjna kinaza w układzie nerwowym

dr hab. Piotr Garstecki (Instytut Chemii Fizycznej, Warszawa)

Dlaczego bakterie E. coli pływają prawą stroną?

prof. Piotr Stępień (Instytut Biochemii i Biofizyki)

Jeden gen wiele funkcji - opowieść o ludzkiej helikazie RNA

dr hab. Marek Tchórzewski (Wydział Biologii i Nauk o Ziemi, UMCS, Lublin)

Struktura i funkcja elementów tworzących rybosomalne centrum GTPazowe

dr Sebastian Kmiecik (Wydział Chemii UW)

Wielkoskalowe symulacje mechanizmów zwijania białek globularnych

prof. Wojciech Rode (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Modyfikacje potranslacyjne a właściwosci katalityczne i niekatalityczne

dr Maciej Długosz (ICM UW)

Asocjacja antybiotyków aminoglikozydowych z rybosomalnym miejscem A. Symulacje dynamiki Brownowskiej.

dr Agnieszka Jabłonowska (IBB)

Spektroskopia mas w badaniach struktury oligomerow peptydu Abeta związanego z chorobą Alzheimera

dr Anna Ajduk (Wydział Biologii, Uniwersytetu Warszawskiego)

Aktywacja rozwoju zarodkowego ssaków

dr Aleksandra Nowicka (Instytut Fizyki PAN)

Identyfikacja genów cech ilościowych QTL (Quantitative Trait Loci) u jabłoni

dr Jerzy Pełka (Instytut Fizyki PAN)

Promieniowanie synchrotronowe w biologii i medycynie

mgr Szymon Niewieczerzał (Instytut Fizyki PAN)

Stan przejściowy dla zwijania się białek w prostych modelach teoretycznych

mgr Izabela Rutkowska-Włodarczyk (Instytut Fizyki PAN)

Spektrometria mas w proteomice: od proteomiki różnicowej i szukania biomarkerów do badania struktur białkowych

Prof. Roy L. Johnston (School of Chemistry, University of Birmingham, UK)

Applications of Natural Computing to the Protein Folding Problem
(Genetic algorithms, ant colony optimization, artificial immune algorithms)

mgr Grzegorz Chojnowski
(Zakład Biofizyki, Instytut Fizyki Doświadczalnej UW i Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie)

Silne i najsilniejsze sygnały w obrazach dyfrakcyjnych kryształów białek

prof. dr hab. Robert Holyst (Instytut Chemii Fizycznej PAN)

Dyfuzja i lepkość w zatłoczonym środowisku od skali nano do skali makro

doc. dr hab. Dariusz Stepkowski (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Rozważania teoretyczne na temat amyldoidogenezy białka prionowego

dr Anna Gambin (Instytut Informatyki Uniwersytetu Warszawskiego)

Stochastyczne modelowanie w analizie danych proteomicznych

doc. dr hab. Krystyna Kolwas (Instytut Fizyki PAN)

Światło jako narzędzie w badaniach przemian energetycznych w mitochondriach plemnikowych

dr Aleksandra Nowicka (Instytut Fizyki PAN)

Tablice częstości podstawień aminokwasowych PAM w kontekście analiz filogenetycznych genomów bakteryjnych

dr Paweł Daniluk (CD Bioexploratorium, Wydział Fizyki UW)

Lokalne deskryptory struktur białkowych. Wprowadzenie teoretyczne oraz zastosowania do analizy i przewidywania struktury

dr Krzysztof Pawłowski (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Zastosowania bioinformatyki w przemyśle faramceutycznym - poszukiwanie nowych genów docelowych dla leków

dr Agnieszka Podlaska (IBB PAN)

Rola proteasomu w odpowiedzi komórek eukariotycznych na uszkodzenia DNA

prof. Danek Elbaum (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Mechanizmy toksyczności beta-amyloidu

dr Antoni Zwiefka (Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN, Wrocław)

Metoda selekcji bibliotek fagowych w badaniach struktury i funkcji białek

dr Dorota Szczepankowska (Instytut Biologii Doświadczalnej PAN)

Wpływ palmitoilokarmityny na zmiany struktury błony komórkowej

dr Wojciech Karlowski (UAM Poznań)

Greenformatics: wybrane metody poznania i analizy genomów roślinnych

dr inż. Justyna Barańska (Instytut Fizyki, Politechnika Poznańska)

Ewolucja konformacji i parametrów węzłów zaciskanych na idealnej linie

mgr. Michał Boniecki (Wydział Chemii UW)

Ciągły i pośredniej rozdzielczości model białka - Refiner: konstrukcja i zastosowania

Dr Michał Wojciechowski (Instytut Fizyki PAN)

Wpływ ciśnienia na oddziaływania wewnątrzcząsteczkowe w ramach gruboziarnistych modeli Go

Dr Piotr Szymczak (Instytut Fizyki Teoretycznej Uniwersytetu Warszawskiego)

Rozciąganie i zwijanie białek pod wpływem stałej siły

Dr Dominik Gront (Wydział Chemii Uniwersytetu Warszawskiego)

Wybrane aspekty modelowania białek w zredukowanej przestrzeni konformacyjnej

mgr Bartosz Różycki (IT UW)

Adhezja błon z aktywnymi składnikami

Dr hab. Andrzej Kloczkowski (Iowa State University)

Przewidywanie struktury drugorzędowej białek

Dr. TOBIAS HENZLER (Bio-Logic - Science Instruments SA, F-38640 Claix, France)

Introduction to the Stopped-flow Technique - Principles and Instrumentation

dr Joanna Trylska (ICM UW)

Właściwości elektrostatyczne i dynamika rybosomu bakteryjnego

dr Michał Wojciechowski (Instytut Fizyki PAN)

Uogólniony model Borna - zalety i wady uproszczonego rozwiązywania Poissona-Boltzmanna

dr Tomasz Lipniacki (IPPT PAN)

Stochastyczna regulacja wczesnej odpowiedzi immunologicznej: Model NF-kappaB

Jan Karbowski (California Institute of Technology)

Fizyczne i biologiczne zasady funkcjonowania mozgu: od robakow C Elegans do ssakow

dr Barbara Wawro (Instytut Biologii Doswiadczalnej PAN iUniversity of Medicine and Dentistry of New Jersey, USA)

Regulacja polimeryzacji aktyn w komórkach: forminy

Bertrand Vileno (Institute of Physics of Complex Matter, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne (EPFL))

From carbon and semiconductor nanostructures to biological targets - photo-oxidative stress

mgr Szymon Niewieczerzal (Instytut Fizyki PAN)

Symulacje procesów asocjacji guaniny z fosforylazą nukleozydów purynowych metodami dynamiki brownowskiej

dr Valentina Tozzini (NEST CNR-INFM i Scuola Normale Superiore, Piza, Wlochy)

Coarse-grained models for large time-scale molecular dynamics simulations

Dr Piotr Pawłowski (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN)

Od retikulocytu do erytrocytu

Prof. Marek Cieplak (Instytut Fizyki PAN)

Stan przejściowy w zwijaniu się białek - model ścisły

Dr Wojciech Dzwolak (Instytut Fizyki Wysokich Cisnień PAN)

O amyloidogenezie, czyli o molekularnej socjopatii białek